微功，亦帝恩矣，義不可背。今者被譴，正以戕親王與招兵故也，而二者皆非我所為。陳情控訴，冀其弭疑；或不見聽，便當薙髮遁世以自明無罪耳。卿等善為身圖，我不敢彎弓向王師矣。」還沒說完，就「作色而起」，令足利直義等「相顧錯愕」。他遁入建長寺，欲剃髮為僧，在左右的勸阻下沒有馬上剃髮。其後，足利直義與諸將私下決定迎戰官軍，結果在十二月五日兵敗手越河原，新田義貞率軍追至伊豆。在此千鈞一髮的時刻，足利直義與上杉重能等偽造數十道綸旨，要求追捕足利尊氏兄弟，「以正朝憲」。足利直義將這些綸旨帶到建長寺，出示給足利尊氏，並慫恿道：「是手越之戰所獲。上意如此，公縱遁於桑門，恐不得免，願思門戶之計。」足利尊氏便奮然而起，說：「死生與汝俱！」馬上脫下僧服，穿上錦直垂，領兵出戰。十二月十一日，足利尊氏在竹下、足利直義在箱根山擊敗官軍，翌日戰於佐野山，大友貞載、鹽冶高貞倒戈投奔足利尊氏，官軍潰敗。十三日，又敗官軍於伊豆。足利尊氏遂率軍長驅西進。

    建武三年（1336年，延元元年）正月，足利尊氏至近江國，攻陷伊岐洲城，在山崎擊破脅屋義助所率官軍。正月十一日，攻入京都。其後一個月，足利尊氏欲進攻後醍醐天皇所在的延曆寺，與脅屋義助、楠木正成等反覆拉鋸，戰局不利。赤松則村勸足利尊氏到九州募兵，再取京都。於是足利尊氏於二月十二日率兵渡海赴九州，二十日抵達大宰府之赤間關，期間十分狼狽，士兵兩千人溺死海中，接着又分遣諸將守備在本州的根據地，所以只有五百人與他相隨，受到當地豪族少貳賴尚的迎接。三月初二日，足利尊氏在多多良濱擊敗菊池武敏所率數萬官軍，在九州站穩腳跟。後醍醐天皇又派新田義貞西征足利尊氏，足利尊氏也決意東進，為師出有名，他請來持明院上皇（光嚴天皇）的院宣，從而造成「兩帝爭國」的局面。四月初三日，足利尊氏讓一色范氏等留在九州，率領少二、大友等九州勢力離開博多。途中與中國、四國勢力會合，兵分兩路，足利尊氏從海路率七千艘水師、足利直義取陸路率二十萬大軍向東進發。四月二十五日，在兵庫和田岬擊敗新田義貞軍，在湊川之戰全殲楠木正成的軍隊。後醍醐天皇在二十七日逃往比叡山。二十九日，足利直義的軍隊進入京都。足利尊氏也在六月十四日奉光嚴天皇及其皇弟豐仁親王進京。八月十五日，豐仁親王在沒有神器的情況下即位，是為光明天皇。之後兩軍持續交戰，由於名和長年等人的戰死，後醍醐天皇方面敗相畢露。後醍醐天皇命令新田義貞奉恆良、尊良兩親王前往北陸，自己則於十月十日按照足利尊氏之前的邀請返京，十一月二日，授予光明天皇神器。建武新政在僅僅兩年半後就宣告結束。

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    七、室町開府

    建武三年（1336年）十一月七日，足利尊氏公佈了《建武式目》的十七條，向天下宣佈幕府的復興，並展示了今後施政的基本方針。這一文件不僅明確了幕府的政策方向，也為室町幕府的建立奠定了法律基礎。從建武三年（1336年）到建武四年（1337年），幕府的組織結構逐漸確立。足利尊氏在這段時間內被拜為權大納言，歷應元年（1338年）八月十一日，他正式就任征夷大將軍，位階進入正二位，室町幕府正式成立。

    在此期間，後醍醐天皇於建武三年（1336年）十二月二十一日秘密逃出京都，潛行至大和吉野，開設朝廷（史稱南朝），與足利尊氏擁立的京都朝廷（史稱北朝）對抗，日本的南北朝時代正式開始。後醍醐天皇呼籲全國討滅足利氏，派遣皇子、諸將在各地努力扶植收復京都的勢力。作為應對，足利尊氏任命一族為守護，配置於各國，特別是在關東、九州等前代以來的有力豪族擁有守護職的地方，設置了關東管領、九州探題，以對抗南朝勢力，形成了對日本的全面控制佈局。

    兩軍的戰鬥在各地展開。北陸方面，新田義貞進入金崎城，與本據地上野、越後聯絡開始活動。重視事態的足利尊氏讓越前守護斯波高經、若狹守護斯波家兼兄弟負責對付新田義貞，並派執事高師直之弟高師泰作為後援。高師泰等在建武四年（1337年）三月攻陷金崎城，尊良親王自殺，恆良親王被捕。斯波軍在此後與新