作為大明的留都，南京官府機構的設置，與京城幾乎是差不多的，這裏有六部和都察院等朝廷機構，也有司禮監和錦衣衛等皇家特別的機構，包括翰林院、國子監等等，都是一應俱全，只是從職責方面來說，南京的六部及都察院等等，與京城的大不一樣，其中最大的不同之處在於，南京沒有內閣。

    按照朝廷的要求，南京是皇太子駐紮的地方，不過這已經是老黃曆了，實際上沒有哪一個皇上真正將太子放在南京的，大都是偶爾去看看，到了萬曆年間，皇太子根本不會到南京去，基本都是留在京城的。

    南京的皇宮，規模比北京的紫禁城要小一些，但這裏是大明朝廷開國的京城，當時稱之為金陵，太祖朱元璋就是在這裏登基的，成立了大明王朝，後來朱棣從建文帝朱允文手中奪過皇位之後，遷都北京，將南京定為留都，將朱元璋的老家鳳陽定位中都。

    南京兵部尚書代表皇上管轄南直隸，包括中都鳳陽，鎮守太監代表皇上駐守在南京皇宮，直接管轄錦衣衛和諸多的太監，為南京京營的監軍，守備勛臣代表皇上管轄南京京營，這三人是南直隸權力最大的人，三人以南京兵部尚書為首。

    南直隸的賦稅，大部分都留在了南京，由南京六部決定如何的開銷，不過隨着時間的推移，南京六部和都察院的權力越來越小，南直隸的賦稅，一部分被直接徵調到京城，進入了戶部的府庫，留給南京戶部開銷的賦稅，數量逐漸減少。

    南直隸是大明最為富庶的地方。儘管京城徵調了部分的賦稅，但留下來的賦稅還是不少的，崇禎元年以來，甚至出現過南京戶部結餘的銀子多餘京城戶部結餘的銀子，當然這不是從總量上面比較，而是在開銷之後。結餘的賦稅方面，南京超過了京城。

    皇上曾經想着從南直隸徵調更多的賦稅和糧食支援遭受災害的北方，可遭遇到朝中大臣的激烈反對，最終不了了之。

    南京六部的官吏，其身份地位與京城的是無法比較的，朝中文武大臣都明白，被派遣到南直隸，基本都是遭遇貶斥或者是年紀大了，安排一個地方頤養天年。南京六部尚書，除開兵部尚書稍微好一些，其餘的悉數都是閒職，沒有多少的事情做，也沒有多大的權力。

    從個人的收入上面來說，那就更無法比較了，京城的官吏，只要是掌握實權的。每年獲取的地方官孝敬的冰敬和炭敬數量不少，這些銀兩足夠京城不少官吏過上奢侈舒心的日子。可南京六部和都察院的官吏就沒有這樣的待遇了，他們所能夠拿到的就是俸祿，其餘的收入幾乎沒有，誰都知道明朝的官吏，依靠俸祿是難以過日子的，不要說奢侈和舒心。能夠保證家人吃飽飯就不錯了。

    不過南京六部的尚書，以及都察院的左右都御史，身份還是尊貴的，畢竟誰也不知道，什麼時候南京六部的尚書和左右都御史。就調到京城的六部和都察院，甚至是直接進入內閣了，出於這樣的考慮，沒有誰敢於明目張胆的得罪他們。

    這麼多年過去，在不少人看來，留都的設立完全是多餘的，無非是安排了一些官吏，沒有起到任何的作用，早就該撤銷了，不過南京的地位不一樣，這關乎到皇家的顏面，故而沒有誰敢於說出來這樣的話語。

    前往南京的鄭勛睿，早就是這樣的看法，在南京設立六部和都察院等官府，完全是勞民傷財，養上那麼多閒人幹什麼，將這些銀子集中起來，還能夠做不少的事情。儘管已經是南京兵部尚書，可鄭勛睿的看法是不會改變的。

    當然，目前的情況之下，鄭勛睿也要慶幸那個篡位成功的明成祖朱棣，他這個南京兵部尚書，與之前的兵部尚書完全不一樣，他要依託這個職位，在最短的時間之內，完全控制南直隸，這裏是大明最為富庶的地方，一旦控制了南直隸，可與朝廷分庭抗禮，接下來控制南面的浙江、江西、福建和廣東等地，以及北面的山東等地，就變得很容易了，至於說河南、湖廣、四川和山西等地，正是流寇肆掠的地方，鄭勛睿暫時沒有打算染指這些地方，就讓流寇好好的去鬧騰，讓朝廷頭疼去。

    崇禎十二年九月十四日，鄭勛睿抵達南京。

    其實這裏是他的家鄉，南京由上元縣和江寧縣組成，皇宮以及六部等機構，悉數都在上元縣，回到南京出任兵部尚書，鄭勛睿其實是回到了家鄉，這將成為他掌控南直隸最大的助力，要知道鄭氏家族在這些年是空前的發展